ARCHS4: Meningkatkan Analisis Dataset RNA-seq dan CHIP-seq
ARCHS4, dikembangkan oleh maayanlabapps, adalah ekstensi browser yang dirancang untuk meningkatkan analisis dataset RNA-seq yang tersedia di Gene Expression Omnibus (GEO). Ekstensi gratis ini menambahkan konten berharga ke halaman landing dataset ini, memberikan pengguna dengan alat dan sumber daya tambahan.
Salah satu fitur utama dari ARCHS4 adalah kemampuan untuk mengunduh file yang berisi pembacaan teralignasi yang dipetakan ke gen dengan hitungan. Ini memungkinkan peneliti untuk dengan mudah mengakses dan menganalisis data mentah, memungkinkan eksplorasi dan interpretasi dataset yang lebih mendalam. Selain itu, ekstensi ini menawarkan ringkasan visualisasi heatmap dari data ekspresi dari sampel yang diproses menggunakan Clustergrammer. Representasi visual ini memberikan pengguna gambaran komprehensif tentang pola ekspresi gen dalam dataset.
Dengan ARCHS4, peneliti dapat dengan mudah mengakses dan menganalisis dataset RNA-seq, menghemat waktu dan usaha dalam eksplorasi dan interpretasi data mereka. Ekstensi browser ini adalah alat berharga bagi mereka yang bekerja di bidang genomik, menyediakan fungsionalitas dan sumber daya yang ditingkatkan untuk analisis dataset.
